感谢Bainternet的提示，实际上这很容易用jQuery实现。

示例（为清晰起见，四个元框已关闭）：

以下是我所做的：

var $j = jQuery.noConflict();
$j(document).ready(function() {
    $j("#side-sortables").append(\'<div id="container_div" class="postbox meta-box-sortables ui-sortable"><div class="handlediv" title="Click to toggle."><br></div><h3 class="hndle"><span>Container Meta Box</span></h3><div id="container_inside" class="inside"></div></div>\');
    $j("#my_metabox_div").appendTo("#container_inside");
    $j("#my_other_metabox_div").appendTo("#container_inside");
    etc...
});

我添加了类meta-box-sortables 和ui-sortable 对于container div，这样还可以对容器中的框进行重新排序（虽然这有点棘手，但是div很容易跳转……）。

然后在我们想要的管理页面上调用此脚本：

function add_admin_scripts( $hook ) {
    // load script on new post page
    if ( $hook == \'post-new.php\' ) {
        wp_enqueue_script( \'group_meta_boxes\', get_bloginfo(\'template_directory\').\'/js/group_meta_boxes.js\' );
    }
}
add_action(\'admin_enqueue_scripts\',\'add_admin_scripts\',10,1);