好吧，我花了一段时间，但我想我已经做到了。我不得不使用usort。我还包括了get_top_level_pages() 方法

    $my_wp_query = new WP_Query();
    $all_wp_pages = $my_wp_query->query(array(\'post_type\' => \'page\', \'posts_per_page\' => \'-1\'));
    $top_level_pages =  get_page_by_title(\'Locations\');
    $menuArray = get_page_children( $top_level_pages->ID, $all_wp_pages );
    function compareOrder($a, $b) {
        return $a->menu_order - $b->menu_order;
    }
    usort($menuArray, \'compareOrder\');

或者，正如我后来发现的那样，我可以将数组中的最后一个值替换为：

public function create_custom_menu() {
    $menuArray = $this->get_top_level_pages();
        foreach ($menuArray as $key => $value) {
            add_menu_page( 
                $value->post_title, 
                $value->post_title, 
                \'manage_options\', 
                $value->post_name.\'-admin-page\', 
                array( $this, \'create_admin_page\'), 
                \'dashicons-admin-home\' ,
                $value->page_attributes->menu-order
            );
      }
}

或者更简单，我可以加上\'orderby\'=>\'menu_order\' 我最初的查询。